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FASTA

作者： Heyu Lin 所有版本

Sublime Text语法包，用于处理FASTA格式

标签 fasta, 语言语法, 生物信息学

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  • 1.0.1
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安装次数

  • 总计 51
  • Win 29
  • Mac 18
  • Linux 4
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Linux 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

读我

源代码
raw.​githubusercontent.​com

sublime-fasta-syntax

让Sublime Text更好地了解FastA格式。

FastA格式是一种常用的文本格式，用于表示生物序列数据，如DNA或蛋白质序列。它由一行序列标题组成，以>字符开始，后面跟着一行或多行序列数据。标题通常包含有关序列的信息，如名称或来源生物体。FastA格式得到生物信息学软件和数据库的广泛支持，常用于序列比对和数据库搜索等任务。

🤩使用软件包控制安装包

如果您还没有安装软件包控制，请首先安装它...

  1. 按Ctrl+Shift+P（Windows）或Cmd+Shift+P（OS X）打开命令面板
  2. 输入安装软件包控制并按Enter选择它。
  3. 等待安装完成

然后安装FASTA包

  1. 按Ctrl+Shift+P（Windows）或Cmd+Shift+P（OS X）打开命令面板
  2. 输入安装包并从面板中选择软件包控制：安装包
  3. 输入fasta以找到此包并单击安装

🦾手动安装

在Sublime Text 4上测试

下载语法文件

下载fasta.sublime-syntax并将其放入Sublime Text用户文件夹：- Windows: %APPDATA%\Sublime Text\Packages\User - Mac: ~/Library/Application Support/Sublime Text/Packages/User - Linux: ~/.config/sublime-text/Packages/User

应用语法

应用程序应该会自动识别扩展名为fa、fasta、faa、fna、ffn或fas的文件。

如果语法未自动应用，您可以通过以下方式指定语法：- 点击菜单 -> 查看选项卡 -> 语法 -> FastA - 点击右下角的'纯文本' -> FastA

change syntax

注意

这是一个帮助 Sublime Text 理解 FastA 格式组成的 语法，而不是一个 主题 或者 配色方案。关键词的颜色根据您通过 菜单 -> 偏好设置 -> 选择配色方案... 选中的 配色方案 来指定。

change color scheme

示例

以下是一些与几个内置配色方案一起使用此语法的例子：1. Monokai Monokai 2. Sixteen Sixteen 3. Mariana Mariana 4. Celeste Celeste